在国家征收的土地上建房房子已经建好占了三平

您在已被国家征收的土地上建房，且占用了三平米左右，这一行为可能构成违法建设。根据《土地管理法》的相关规定，未经批准非法占用土地的，由县级以上人民政府自然资源主管部门责令退还非法占用的土地。考虑到您占用面积较小，若及时补办相关手续或拆除违法建筑，可能面临较轻的法律责任。但具体后果还需根据当地法律法规和实际情况判断。
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从法律角度，您应立即停止违法行为，并咨询当地自然资源主管部门了解具体补救措施。若可补办手续，应尽快完成；若无法补办，则需考虑拆除。同时，注意保留相关证据，以备不时之需。在处理过程中，务必遵守法律法规，避免进一步违法。
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若想合法化这处建筑，您可尝试以下操作：1. 向当地自然资源主管部门申请补办用地手续，缴纳相应的土地使用权出让金等费用；2. 若该地块规划已调整，不符合建房条件，则需考虑拆除违法建筑。具体操作需根据当地规划和自然资源部门的指导进行。